简介...
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本期节目,我们请到了来自美国贝勒医学院人类基因组测序中心的郑欣畅博士,一起聊一聊三代测序在基因组结构变异分析中的重要作用,并介绍他们团队最新的工作STIX:结构变异注释工具。
主要内容
01:48 郑欣畅博士在中国科学院北京基因组所的一些工作
06:29 结构变异研究的重要科学问题:如何准确计算人群频率?
09:25 STIX软件的开发
13:57 使用long-read数据对STIX进行升级
20:14 大家应该如何使用STIX工具注释自己的结构变异
相关链接
国家生物信息中心数据库概览:https://www.cncb.ac.cn/
STIX preprint paper:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.30.615931v1
STIX API:https://github.com/zhengxinchang/stix_web_frontend
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空空如也

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湛姽婳
8个月前 北京
2
想啥来啥,终于知道三代测序做结构变异的各个知识了,感谢赵老师和郑老师
湛姽婳
8个月前 河北
1
三代测序升级啦,刚刚在他们官网看到的,给大家同步一下: 接下来让我们看看新的SPRQ化学能给Revio测序平台带来哪些增强: 将DNA起始量从2ug降低到500ng,配合Nanobind核酸提取试剂盒可以对唾液样本进行长片段核酸提取和测序,大大降低了人群队列研究的样本要求。 每张Revio SMRT Cell的HiFi数据产出量增加了33%,显著降低了人类全基因组测序的成本。 通过机载分析流程的算法升级,提升了5mC检测的准确率并新增了6mA检测以支持Fiber-seq测序。
Gilly_Yang
7个月前 未知
1
好节目,学到了很多,听众门槛还是有点高的
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