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本期节目,我们请到了来自美国西北大学的赵恒强博士,一起探讨三维基因组的测序方法的由来,对于临床诊断和治疗的潜在应用,以及未来的发展方向。

主要内容

01:38 什么是三维基因组?

04:50 什么是Hi-C技术

09:10 如何优化三维基因组分析的运算量

10:30 三维基因组的下游分析:染色体疆域;AB compartment;拓扑结构域(TAD);染色质环(enhancer-promoter相互作用)

14:48 三维基因组在医学遗传中的应用

18:50 三维基因组在治疗中的应用

20:13 能否通过人工智能预测三维基因组结构

23:36 恒强实验室的最新研究进展

相关术语及文献

TAD:拓扑结构域(英语:Topological domains)或称为拓扑相关结构域(Topologically associating domains,简称TAD)是染色质亚结构的学术名称

Hi-C技术:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22652625/

从epigenetic数据直接预测三维基因组图谱的工具:

https://www.pnas.org/doi/full/10.1073/pnas.1714980114

https://academic.oup.com/bib/article/25/2/bbae096/7630477

https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-023-02934-9

http://biorxiv.org/cgi/content/short/2024.07.17.603864v1?rss=1


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