Microbial Matters, a podcast introducing latest microbiome research. J. Suez, Y. Cohen, R. Valdés-Mas, U. Mor, M. Dori-Bachash, S. Federici, N. Zmora, A. Leshem, M. Heinemann, R. Linevsky, M. Zur, R. B.-Z. Brik, A. Bukimer, S. Eliyahu-Miller, A. Metz, R. Fischbein, O. Sharov, S. Malitsky, M. Itkin, N. Stettner, A. Harmelin, H. Shapiro, C. K. Stein-Thoeringer, E. Segal, E. Elinav, Personalized microbiome-driven effects of non-nutritive sweeteners on human glucose tolerance. Cell (2022), doi:10.1016/j.cell.2022.07.016. Thanks for listening! You can listen to more episodes in your favorite podcast platform like Spotify, Google Podcasts and Apple Podcasts. You can also leave your comments, it’ll really help my podcast. You can also support my podcast “Microbial Matters” on Anchor: anchor.fm.

一支穿云箭，千菌万码来相见！大家好，我是张禅跑。 今天介绍的文章是：Personalized microbiome-driven effects of non-nutritive sweeteners on human glucose tolerance （甜味剂对葡萄糖耐受的影响是个人化的，且由菌群驱动）. 在2022年8月发表于Cell细胞杂志。 第一作者： Jotham Suez, Yotam Cohen 通讯作者：Eran Segal, Eran Elinav 通讯单位：Weizmann Institute of Science 以色列魏茨曼科学研究所 00:38 Eran们的实验室过往研究简介 02:10 甜味剂简介及个人味觉感受 04:14 不同甜味剂代谢的区别以及“0卡”的秘密 05:36 正文介绍：实验设计 07:39 主要结论一：糖精和三氯蔗糖可逆地影响糖耐度 08:20 主要结论二：肠道菌群介导了糖耐度变化，对甜味剂的响应因人而异 09:23 研究局限 10:09 甜味剂不是洪水猛兽，管住嘴迈开腿是正解 J. Suez, Y. Cohen, R. Valdés-Mas, U. Mor, M. Dori-Bachash, S. Federici, N. Zmora, A. Leshem, M. Heinemann, R. Linevsky, M. Zur, R. B.-Z. Brik, A. Bukimer, S. Eliyahu-Miller, A. Metz, R. Fischbein, O. Sharov, S. Malitsky, M. Itkin, N. Stettner, A. Harmelin, H. Shapiro, C. K. Stein-Thoeringer, E. Segal, E. Elinav, Personalized microbiome-driven effects of non-nutritive sweeteners on human glucose tolerance. Cell (2022), doi:10.1016/j.cell.2022.07.016. 原文链接：www.cell.com(22)00919-9 您还可以在Spotify、Apple Podcasts、Google Podcasts等平台找到我。感谢您的收听！ 您可以在小宇宙APP给我留言提出宝贵意见！您还可以在爱发电平台搜索“千菌万码”以及在微信公众号“千菌万码”给我打赏！谢谢大家！

一支穿云箭，千菌万码来相见！大家好，我是张禅跑。 今天介绍的文章是：Akkermansia muciniphila phospholipid induces homeostatic immune responses （嗜黏蛋白阿克曼菌的磷脂诱导稳态免疫响应）.在2022年7月发表于Nature自然杂志。 第一作者： Munhyung Bae, Chelsi D. Cassilly 通讯作者：Ramnik J. Xavier, Jon Clardy 通讯单位：哈佛医学院，博德研究所 00:51 阿克曼菌与人类健康 02:05 阿克曼菌身上啥是宝？ 03:22 阿克曼菌的“精油” 05:16 PE的结构与活性的关系 05:55 阿克曼菌PE的免疫调节效果 07:46 拓展阅读：人类病菌的磺酸脂 M. Bae, C. D. Cassilly, X. Liu, S.-M. Park, B. K. Tusi, X. Chen, J. Kwon, P. Filipčík, A. S. Bolze, Z. Liu, H. Vlamakis, D. B. Graham, S. J. Buhrlage, R. J. Xavier, J. Clardy, Akkermansia muciniphila phospholipid induces homeostatic immune responses. Nature, 1–6 (2022). 原文链接：https://www.nature.com/articles/s41586-022-04985-7 您还可以在Spotify、Apple Podcasts、Google Podcasts等平台找到我。感谢您的收听！您可以在小宇宙APP给我留言提出宝贵意见！您还可以在爱发电平台搜索“千菌万码”以及在微信公众号“千菌万码”给我打赏！谢谢大家！

一支穿云箭，千菌万码来相见！大家好，我是张禅跑。 不知道大家能不能听出来，这是我换了新话筒以后录的第一期节目，我趁Prime Day买了一个AmazonBasics的一个电容话筒，不知道音质有没有提升？ 今天介绍的文章是：Gut metabolites predict Clostridioides difficile recurrence （肠道代谢物预测艰难梭菌复发）。在2022年6月发表于Microbiome（微生物组）上。 第一作者： Jennifer J. Dawkins, Jessica R. Allegretti 通讯作者：Georg K. Gerber 通讯单位：哈佛医学院 00:56 艰难梭菌反复感染 02:10 研究设计 03:07 代谢组是最佳预测变量 04:13 哪些分子与感染复发相关？ 05:43 菌群功能比菌群组成更重要！ J. J. Dawkins, J. R. Allegretti, T. E. Gibson, E. McClure, M. Delaney, L. Bry, G. K. Gerber, Gut metabolites predict Clostridioides difficile recurrence. Microbiome. 10, 87 (2022). 原文链接：https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-022-01284-1 感谢您的收听！您可以在小宇宙APP给我留言提出宝贵意见！您还可以在爱发电平台搜索“千菌万码”以及在微信公众号“千菌万码”给我打赏！谢谢大家！

一支穿云箭，千菌万码来相见！大家好，我是张禅跑。 今天介绍的文章是：A centimeter-long bacterium with DNA contained in metabolically active, membrane-bound organelles （一个厘米级的、DNA在代谢活跃、膜包裹的细胞器中的细菌）。在2022年6月发表于Science科学杂志。 第一作者： Jean-Marie Volland, Silvina Gonzalez-Rizzo, Olivier Gros 通讯作者：Tanja Woyke, Shailesh V. Date 通讯单位：美国劳伦斯伯克利国家实验室等 00:57 突破性发现一：巨大的肉眼可见的细菌！ 03:17 突破性发现二：细菌内有非常多带膜的细胞器！ 细菌与硬币的对比！ J.-M. Volland, S. Gonzalez-Rizzo, O. Gros, T. Tyml, N. Ivanova, F. Schulz, D. Goudeau, N. H. Elisabeth, N. Nath, D. Udwary, R. R. Malmstrom, C. Guidi-Rontani, S. Bolte-Kluge, K. M. Davies, M. R. Jean, J.-L. Mansot, N. J. Mouncey, E. R. Angert, T. Woyke, S. V. Date, A centimeter-long bacterium with DNA contained in metabolically active, membrane-bound organelles. Science. 376, 1453–1458 (2022). 原文链接：https://www.science.org/doi/10.1126/science.abb3634 感谢您的收听！您可以在小宇宙APP给我留言提出宝贵意见！您还可以在爱发电平台搜索“千菌万码”以及在微信公众号“千菌万码”给我打赏！谢谢大家！

一支穿云箭，千菌万码来相见！大家好，我是张禅跑。 今天介绍的文章是：High-throughput, single-microbe genomics with strain resolution, applied to a human gut microbiome （高通量、有菌株解析度的单细菌基因组应用于人类肠道菌群）；2022年6月发表于Science科学杂志上。 第一作者： 郑文山、赵诗杰 通讯作者：Peter Lu, Eric Alm, David Weitz 通讯单位：哈佛大学，麻省理工学院 00:55 研究菌群基因组的几种策略与其局限性 03:06 微流控技术Microfluidics简介 04:30 正文介绍，Microbe-Seq 08:03 Microbe-Seq的局限 08:54 利益相关声明 W. Zheng, S. Zhao, Y. Yin, H. Zhang, D. M. Needham, E. D. Evans, C. L. Dai, P. J. Lu, E. J. Alm, D. A. Weitz, High-throughput, single-microbe genomics with strain resolution, applied to a human gut microbiome. Science. 376 (2022), doi:10.1126/science.abm1483. 原文链接：https://www.science.org/doi/10.1126/science.abm1483 感谢您的收听！您可以在小宇宙APP给我留言提出宝贵意见！您还可以在爱发电平台搜索“千菌万码”以及在微信公众号“千菌万码”给我打赏！谢谢大家！

一支穿云箭，千菌万码来相见！大家好，我是张禅跑。 今天介绍的文章是：Noninvasive assessment of gut function using transcriptional recording sentinel cells (使用转录记录的哨兵细胞进行肠道功能的非侵入评估)。在2022年5月发表于Science科学杂志。 第一作者： Florian Schmidt, Jakob Zimmermann, Tanmay Tanna 通讯作者：Andrew Macpherson, Randall Platt 通讯单位：ETH Zurich苏黎世联邦理工学院, 伯尔尼大学 01:07 Record-Seq背景介绍 02:30 正文介绍 03:46 吐槽1：Record-Seq的系统性偏差 04:57 吐槽2：Record-Seq无法在时间上调控 06:23 小鼠食粪对Record-Seq的进一步干扰 06:51 吐槽3：Record-Seq丢失了时序信息 07:42 吐槽4：大肠杆菌哨兵细胞的劣势 F. Schmidt, J. Zimmermann, T. Tanna, R. Farouni, T. Conway, A. J. Macpherson, R. J. Platt, Noninvasive assessment of gut function using transcriptional recording sentinel cells. Science. 376(2022), doi:10.1126/science.abm6038. 原文链接：https://www.science.org/doi/10.1126/science.abm6038 感谢您的收听！您可以在微信搜索jun000ma0000找到我的公众号“千菌万码”，也可以在小宇宙APP给我留言提出宝贵意见！您还可以在爱发电平台搜索“千菌万码”给我打赏！谢谢大家！

一支穿云箭，千菌万码来相见！大家好，我是张禅跑。 今天介绍的文章是：Dosing a synbiotic of human milk oligosaccharides and B. infantis leads to reversible engraftment in healthy adult microbiomes without antibiotics （人奶寡聚糖与婴儿双歧杆菌组成的共生元可以在不服用抗生素的健康成人菌群中可逆移植）。在2022年5月发表于cell host & microbe (细胞 - 宿主与微生物）。 第一作者： Julie Button 通讯作者：Gregory McKenzie 通讯单位：Prolacta Bioscience公司 01:23 为什么公司希望使用完全已知成分的配方进行菌群移植？菌群移植需要克服什么“抵抗”？ 02:56 益生元prebiotic，益生菌symbiotic，共生元synbiotic 04:50 人奶寡聚糖HMO 05:45 为什么用婴儿双歧杆菌？ 06:47 文章正文介绍 13:23 安全性、普适性与展望 J. E. Button, C. A. Autran, A. L. Reens, C. M. Cosetta, S. Smriga, M. Ericson, J. V. Pierce, D. N. Cook, M. L. Lee, A. K. Sun, A. M. Alousi, A. Y. Koh, D. J. Rechtman, R. R. Jenq, G. J. McKenzie, Dosing a synbiotic of human milk oligosaccharides and B. infantis leads to reversible engraftment in healthy adult microbiomes without antibiotics. Cell Host Microbe(2022), doi:10.1016/j.chom.2022.04.001. 原文链接： https://www.cell.com/cell-host-microbe/fulltext/S1931-3128(22)00207-4 感谢您的收听！您可以在微信搜索jun000ma0000找到我的公众号“千菌万码”，也可以在小宇宙APP给我留言提出宝贵意见！您还可以在爱发电平台搜索“千菌万码”给我打赏！

一支穿云箭，千菌万码来相见！大家好，我是张禅跑。 今天介绍的文章是：Metagenome assembly of high-fidelity long reads with hifiasm-meta（使用hifiasm-meta进行高保真长读长测序的宏基因组组装）。2022年5月发表于Nature Methods（自然-方法）。 第一作者： Xiaowen Feng 通讯作者：Heng Li 通讯单位：丹娜-法伯癌症研究所 00:24 “千菌万码”名字的来源 03:09 长读长测序原理与优缺点 06:40 文章介绍 H. Cheng, G. T. Concepcion, X. Feng, H. Zhang, H. Li, Haplotype-resolved de novo assembly using phased assembly graphs with hifiasm. Nat Methods. 18, 170–175 (2021). X. Feng, H. Cheng, D. Portik, H. Li, Metagenome assembly of high-fidelity long reads with hifiasm-meta. Nat Methods, 1–4 (2022). 原文链接： https://www.nature.com/articles/s41592-022-01478-3 感谢您的收听！您可以在微信搜索jun000ma0000找到我的公众号“千菌万码”，也可以在小宇宙APP给我留言提出宝贵意见！您还可以在爱发电平台搜索“千菌万码”给我打赏！

一支穿云箭，千菌万码来相见！大家好，我是张禅跑。 今天介绍的文章是：Fecal microbiota transfer between young and aged mice reverses hallmarks of the aging gut, eye, and brain （年轻与年老的小鼠之间的粪菌移植逆转了肠道、眼睛和大脑的衰老特征），在2022年4月发表于Microbiome。 第一作者：Aimee Parker (兼通讯作者） 通讯作者：Simon Carding 通讯单位：Quadram Institute (英国诺维奇） A. Parker, S. Romano, R. Ansorge, A. Aboelnour, G. L. Gall, G. M. Savva, M. G. Pontifex, A. Telatin, D. Baker, E. Jones, D. Vauzour, S. Rudder, L. A. Blackshaw, G. Jeffery, S. R. Carding, Fecal microbiota transfer between young and aged mice reverses hallmarks of the aging gut, eye, and brain. Microbiome. 10, 68 (2022). https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-022-01243-w 您可以在微信搜索jun000ma0000找到我的公众号“千菌万码”，也可以在小宇宙APP给我留言提出宝贵意见！您还可以在爱发电平台搜索“千菌万码”给我打赏！

一支穿云箭，千菌万码来相见！欢迎来到介绍最新肠道菌群研究的播客。 封面：小鼠大肠切片后的荧光成像。By Kristen Earle, Gabriel Billings, KC Huang, Justin Sonnenburg. 此图获得2015尼康小世界显微摄影大赛亚军。