EP2: 使用hifiasm-meta进行高保真长读长测序的宏基因组组装
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EP2: 使用hifiasm-meta进行高保真长读长测序的宏基因组组装

14分钟 97 3年前
节目简介
来源:小宇宙

一支穿云箭,千菌万码来相见!大家好,我是张禅跑。


今天介绍的文章是:Metagenome assembly of high-fidelity long reads with hifiasm-meta(使用hifiasm-meta进行高保真长读长测序的宏基因组组装)。2022年5月发表于Nature Methods(自然-方法)。


第一作者: Xiaowen Feng


通讯作者:Heng Li


通讯单位:丹娜-法伯癌症研究所



00:24 “千菌万码”名字的来源


03:09 长读长测序原理与优缺点


06:40 文章介绍





H. Cheng, G. T. Concepcion, X. Feng, H. Zhang, H. Li, Haplotype-resolved de novo assembly using phased assembly graphs with hifiasm. Nat Methods. 18, 170–175 (2021).






X. Feng, H. Cheng, D. Portik, H. Li, Metagenome assembly of high-fidelity long reads with hifiasm-meta. Nat Methods, 1–4 (2022).


原文链接:


https://www.nature.com/articles/s41592-022-01478-3


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