电影的时代背景是幻想中的欧洲大陆，在一座金矿里流传着理想世界天空之城拉普达的传说，据说那里拥有无尽的宝藏和和控制世界的奇异能力，生活在矿山里的男孩帕索对这个传说深信不疑，因为他的父亲就曾经拍到过天空之城的照片。有一天帕索救了从天上慢慢飘下来的女孩希达，她脖子上戴的飞行石项链引来了军队和海盗，原来希达就是来自天空之城的孩子，那块飞行石也代表了寻获史前文明拉普达的唯一线索。